1.2. 点阵图¶
点阵图(dotplot)是比较两条蛋白质或核苷酸 序列 的最简单、最古老的方法之一,它是一种以可视/图形方式观察两条序列之间相似区域的手段。
如何操作 ?
取两条长度相近或不同的序列。
把其中一条序列的每个字母写在一行中。
把另一条序列的每个字母写在一列中。
当序列 1 的字母与序列 2 的字母相同时,在对应方格中填入标记,反之亦然。
若字母不同,则对应位置留空。
优点 :
适合识别长距离的强相似区域。
易于制作和解读。
可用于任意长度的序列。
缺点 :
图形表示无法提供关于突变的信息。

